VetBact

Inledning

Med termen genom menar man den kompletta uppsättningen av genetisk material i en cell. Genomstorlek brukar uttryckas i Mb eller Mbp (= megabaspar). Alltså är 1 Mbp = 1 000 000 bp. Storleken på bakteriegenom varierar mellan 0,5 och 10 Mbp. Bakteriegenom består av kromosom(er) och eventuellt även plasmid(er). Bakterier är haploida till skillnad från högre organismer, som är diploida. Könsceller från högre organismer är emellertid också haploida. Den fullständiga genomsekvensen har bestämts för ca 30 000 bakteriestammar och det finns ytterligare ca 20 000 publicerade genomprojekt för bakterier, där man inte har kombinerat delsekvenserna till en enda fullständig sekvens (en s.k. kontig).

Kromosom

Kromosomen utgör primärt genetiskt material, som är helt nödvändigt för bakterien. Bakterier har i allmänhet en cirkulär kromosom, men det finns undantag (se nedan).

Plasmid

Plasmider (see också Genom ovan) utgör sekundärt genetiskt material, som inte alltid är livsnödvändigt för bakterien. Bakterier, som bär på plasmider, har i allmänhet en eller flera cirkulära plasmider men det finns också undantag. Plasmider utgör i allmänhet upp till 10% av genomet och de replikeras oberoende av kromosomen.

Undantag

• Arter inom släktena Brucella, Burkholderia, Leptospira och Vibrio har två cirkulära kromosomer
• Arter inom släktet Borrelia har en linjär och relativt liten kromosom (ca. 1 Mbp).
• Arter inom släktet Borrelia har även linjära plasmider och dessa är essentiella för bakterien.
• Arter inom släktet Streptomyces har en linjär och relativt stor kromosom (ca. 10 Mbp).

Uppdaterad: 2020-09-23.